菲利佩和阿什兰•库斯托与海洋生物学家卢克•蒂普尔一起来到比基尼环礁。冷战期间，这里因成为核试验基地而被毁。探访期间，他们发现这里仍聚集着大量的礁鲨，这一发现令人震惊。

露西婶婶的生日即将到来，帕丁顿决定送婶婶一份会让她终生难忘的礼物。最终，帕丁顿选中了一本立体绘本，然而这绘本是世间仅此一份的珍贵宝物，为了存钱购买绘本，帕丁顿决定开始工作，在遭遇了一连串的失败后，帕丁顿终于找到了适合他的工作——清洁玻璃窗。就在帕丁顿的存款即将达标之际，绘本竟然被一名神出鬼没的小偷给偷走了，同时出现在案…

故事围绕一只年轻的秘鲁小熊展开。这只喜欢吃柠檬酱的小熊（本·卫肖 Ben Whishaw 配音）从暗无天日的秘鲁抵达伦敦，在伦敦的的帕丁顿站迷路了，它呆在失物招领处外，坐在一只被压扁行李箱上，大衣上挂着一个牌子：“请照顾这只熊。谢谢。”于是遇到了一个人类家庭并与他们朝夕相处，因为小熊的秘鲁名字没人能明白，所以善良的人类家庭就根据车…