以木木豆为首的四位小侦探与神秘组织斗智斗勇，顺着父亲留下的笔记为线索，前往各个星球搜寻神秘组织的珠子马迹，沿途成功破获各种离奇案件，最后协助宇宙安全局成功搞毁神秘组织。