迪迦离开后的第8年，即2017年，主人公飞鸟信的父亲飞鸟一马，是在光中消失的宇航飞行员。当时的飞鸟还和他的父亲约定回来看他打棒球，在此时他却从戴民长官那里得知了噩耗。飞鸟长大后，加入了地球和平联合组织TPC，在一次模拟战争中一举击败了SUPER GUTS的王牌飞行员由美村良，然而此时他却遇到了宇宙球体“斯菲亚”，虽然他奋力战斗，却寡不敌…

来自半人马座比邻星的外星人哈哈，与数十亿年前比邻星人从地球带走的恐龙蛋中孵化出的，全宇宙最后一只恐龙哈小龙，来到地球，与以爱科学的小学\u201c女汉子\u201d公孙兰，以及她的爸爸妈妈、少科站的伙伴诸葛聪明、杨燕，竞争对手司马晴空及其跟班夏冬等，在少科站、家中和街心花园等地发生种种生活趣事，哈哈为了重返比邻星，哈小龙为了复辟恐…