故事发生在1926年的纽约，彼时，麻鸡们对魔法师的抵制达到了最高峰，由玛丽露所领导的反魔法组织活动频繁。与此同时，街头巷尾之中时时发生的种种灾难意外让魔法世界的存在离暴露仅有一线之隔，整个魔法部陷入了空前紧张的气氛之中。就在这个节骨眼上，环游世界进行着研究神奇魔法动物之行动的魔法动物学家纽特抵达了纽约，他随身携带的魔法手提…

阿不思·邓布利多教授（裘德·洛 饰）意识到强大的黑巫师盖勒特·格林德沃（麦斯·米科尔森 饰）正试图夺取魔法世界的控制权。邓布利多了解仅凭他一人之力，将无法阻止格林德沃，于是他委托魔法动物学家纽特·斯卡曼德（埃迪·雷德梅恩 饰）带领一支精良的团队——成员包括男巫、女巫及一位勇敢的麻瓜面包师，来共同执行这项危险任务。一路上他…