诞生在宇宙群星之间的神秘种子，以帮助智慧生命突破文明瓶颈为使命，它们被称之为“超神学院”。超神学院孕育着成为神，乃至超越神的强大生命体。当星际战争降临，这些被创造出来的“神”，将不可避免地卷入宇宙纷争，变成宇宙中最绚烂的星辰，或是毁灭万物的武器！

高中一年级的白石纯太， 是一个零存在感的“路人”男生。|同班的“女主角级”美少女·久保同学居然是唯一能找到他的人，并且总是戏弄他。|无法成为特别存在的“路人”男生，和出现在他面前的“女主角”女生。|在教室的一角，青春的色彩开始逐渐丰富——。|无论是谁，都可以成为某个人“特别”的存在。但是这份感情对尚且稚嫩的两人来说，还不能…